Mryntu

NLRP12;
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB ;
Список кодів PDB
	; 2L6A, 4XHS; ;
Ідентифікатори;
; Символи;	; NLRP12, CLR19.3, FCAS2, NALP12, PAN6, PYPAF7, RNO, RNO2, NLR family, pyrin domain containing 12, NLR family pyrin domain containing 12
Зовнішні ІД	; OMIM: 609648 MGI: 2676630 HomoloGene: 16972 GeneCards: NLRP12 ;
Онтологія гена
Молекулярна функція	; • nucleotide binding; • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process; • ATP binding; • protein binding; ; ;
Клітинна компонента	; • Цитоплазма; • клітинне ядро; ; ;
Біологічний процес	; • regulation of interleukin-18 biosynthetic process; • dendritic cell migration; • positive regulation of interleukin-1 beta secretion; • negative regulation of interleukin-1 secretion; • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • negative regulation of Toll signaling pathway; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • negative regulation of inflammatory response; • cellular response to cytokine stimulus; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of inflammatory response; • negative regulation of protein autophosphorylation; • positive regulation of MHC class I biosynthetic process; • negative regulation of interleukin-6 biosynthetic process; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • negative regulation of cytokine secretion; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • negative regulation of signal transduction; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; ; ;
	Джерела:Amigo / QuickGO;
Ортологи
	; 91662;
	; 378425;
	; ENSG00000142405;
	н/д;
	; P59046;
	; E9Q5R7;
	; NM_001277126; NM_001277129; NM_033297; NM_144687;
	; NM_001033431;
	; NP_001264055; NP_001264058; NP_653288;
	; NP_001028603;
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NLRP12 (англ. NLR family pyrin domain containing 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 061 амінокислот, а молекулярна маса — 120 173^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLRTAGRDGL	CRLSTYLEEL	EAVELKKFKL	YLGTATELGE	GKIPWGSMEK
AGPLEMAQLL	ITHFGPEEAW	RLALSTFERI	NRKDLWERGQ	REDLVRDTPP
GGPSSLGNQS	TCLLEVSLVT	PRKDPQETYR	DYVRRKFRLM	EDRNARLGEC
VNLSHRYTRL	LLVKEHSNPM	QVQQQLLDTG	RGHARTVGHQ	ASPIKIETLF
EPDEERPEPP	RTVVMQGAAG	IGKSMLAHKV	MLDWADGKLF	QGRFDYLFYI
NCREMNQSAT	ECSMQDLIFS	CWPEPSAPLQ	ELIRVPERLL	FIIDGFDELK
PSFHDPQGPW	CLCWEEKRPT	ELLLNSLIRK	KLLPELSLLI	TTRPTALEKL
HRLLEHPRHV	EILGFSEAER	KEYFYKYFHN	AEQAGQVFNY	VRDNEPLFTM
CFVPLVCWVV	CTCLQQQLEG	GGLLRQTSRT	TTAVYMLYLL	SLMQPKPGAP
RLQPPPNQRG	LCSLAADGLW	NQKILFEEQD	LRKHGLDGED	VSAFLNMNIF
QKDINCERYY	SFIHLSFQEF	FAAMYYILDE	GEGGAGPDQD	VTRLLTEYAF
SERSFLALTS	RFLFGLLNEE	TRSHLEKSLC	WKVSPHIKMD	LLQWIQSKAQ
SDGSTLQQGS	LEFFSCLYEI	QEEEFIQQAL	SHFQVIVVSN	IASKMEHMVS
SFCLKRCRSA	QVLHLYGATY	SADGEDRARC	SAGAHTLLVQ	LPERTVLLDA
YSEHLAAALC	TNPNLIELSL	YRNALGSRGV	KLLCQGLRHP	NCKLQNLRLK
RCRISSSACE	DLSAALIANK	NLTRMDLSGN	GVGFPGMMLL	CEGLRHPQCR
LQMIQLRKCQ	LESGACQEMA	SVLGTNPHLV	ELDLTGNALE	DLGLRLLCQG
LRHPVCRLRT	LWLKICRLTA	AACDELASTL	SVNQSLRELD	LSLNELGDLG
VLLLCEGLRH	PTCKLQTLRL	GICRLGSAAC	EGLSVVLQAN	HNLRELDLSF
NDLGDWGLWL	LAEGLQHPAC	RLQKLWLDSC	GLTAKACENL	YFTLGINQTL
TDLYLTNNAL	GDTGVRLLCK	RLSHPGCKLR	VLWLFGMDLN	KMTHSRLAAL
RVTKPYLDIG	C

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.
Локалізований у цитоплазмі.

Література |

.mw-parser-output .refbeginfont-size:90%;margin-bottom:0.5em.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ullist-style-type:none;margin-left:0.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>ddmargin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none.mw-parser-output .refbegin-100font-size:100%

Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation.. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95 — 104. PubMed DOI:10.1038/nrm1019

Shami P.J., Kanai N., Wang L.Y., Vreeke T.M., Parker C.J. (2001). Identification and characterization of a novel gene that is upregulated in leukaemia cells by nitric oxide.. Br. J. Haematol. 112: 138 — 147. PubMed DOI:10.1046/j.1365-2141.2001.02491.x

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Pinheiro A.S., Eibl C., Ekman-Vural Z., Schwarzenbacher R., Peti W. (2011). The NLRP12 pyrin domain: structure, dynamics, and functional insights.. J. Mol. Biol. 413: 790 — 803. PubMed DOI:10.1016/j.jmb.2011.09.024

Примітки |

↑ Human PubMed Reference:.

↑ Mouse PubMed Reference:.

↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22938 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

↑ UniProt, P59046 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також |

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22938 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P59046 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

搜尋此網誌

Mryntu

Література |

Примітки |

Див. також |

Popular posts from this blog