XRN1 Література | Примітки | Див. також | Навігаційне менюXRN18919645894XRN1DNA bindingprotein bindingnucleic acid bindingnuclease activityexonuclease activityhydrolase activityRNA bindingG-quadruplex RNA bindingG-quadruplex DNA binding5'-3' exoribonuclease activitytelomerase RNA binding5'-3' exonuclease activityмембранаЦитоплазматична мембранаклітинне ядроЦитоплазмаГіалоплазмаДендрит (нейробіологія)neuronal cell bodyСинапсP-bodyregulation of mRNA stabilityrRNA catabolic processnuclear mRNA surveillancehistone mRNA catabolic processnegative regulation of translationresponse to testosteronecellular response to cycloheximideRNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolyticcellular response to puromycinnegative regulation of telomere maintenance via telomerasenuclear-transcribed mRNA catabolic processAmigoQuickGO5446424127ENSG00000114127ENSMUSG00000032410Q8IZH2P97789NM_001042604NM_001282857NM_001282859NM_019001NM_011916NM_001311130NP_001269786NP_001269788NP_061874Хр. 3: 142.31 – 142.45 MbХр. 9: 95.95 – 96.06 MbPubMed10.1101/gr.2596504PubMed10.1016/S1097-2765(03)00349-6PubMed10.1101/gad.1282305PubMed10.1101/gad.1622708PubMedHuman PubMed Reference:Mouse PubMed Reference:HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30654UniProt, Q8IZH2виправивши або дописавши їїпідказкою

Гени на хромосомі 3Некатегоризовані білки


англ.амінокислотмолекулярна масагідролазекзонуклеазнуклеазфосфопротеїнівальтернативний сплайсингДНКРНКцитоплазмі


































XRN1
Ідентифікатори

Символи

XRN1, SEP1, 5'-3' exoribonuclease 1
Зовнішні ІД
MGI: 891964 HomoloGene: 5894 GeneCards: XRN1








Ортологи
ВидиЛюдинаМиша
Entrez

54464


24127
Ensembl

ENSG00000114127


ENSMUSG00000032410
UniProt

Q8IZH2


P97789
RefSeq (мРНК)

NM_001042604
NM_001282857
NM_001282859
NM_019001


NM_011916
NM_001311130
RefSeq (білок)

NP_001269786
NP_001269788
NP_061874

н/д
Локус (UCSC)
Хр. 3: 142.31 – 142.45 Mb

Хр. 9: 95.95 – 96.06 Mb

PubMed search
[1]
[2]
Вікідані


Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

XRN1 (англ. 5'-3' exoribonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-ї хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 706 амінокислот, а молекулярна маса — 194 107[4].



Послідовність амінокислот





























































































































































































































































































































1020304050

MGVPKFYRWI

SERYPCLSEV

VKEHQIPEFD

NLYLDMNGII

HQCSHPNDDD

VHFRISDDKI

FTDIFHYLEV

LFRIIKPRKV

FFMAVDGVAP

RAKMNQQRGR

RFRSAKEAED

KIKKAIEKGE

TLPTEARFDS

NCITPGTEFM

ARLHEHLKYF

VNMKISTDKS

WQGVTIYFSG

HETPGEGEHK

IMEFIRSEKA

KPDHDPNTRH

CLYGLDADLI

MLGLTSHEAH

FSLLREEVRF

GGKKTQRVCA

PEETTFHLLH

LSLMREYIDY

EFSVLKEKIT

FKYDIERIID

DWILMGFLVG

NDFIPHLPHL

HINHDALPLL

YGTYVTILPE

LGGYINESGH

LNLPRFEKYL

VKLSDFDREH

FSEVFVDLKW

FESKVGNKYL

NEAAGVAAEE

ARNYKEKKKL

KGQENSLCWT

ALDKNEGEMI

TSKDNLEDET

EDDDLFETEF

RQYKRTYYMT

KMGVDVVSDD

FLADQAACYV

QAIQWILHYY

YHGVQSWSWY

YPYHYAPFLS

DIHNISTLKI

HFELGKPFKP

FEQLLAVLPA

ASKNLLPACY

QHLMTNEDSP

IIEYYPPDFK

TDLNGKQQEW

EAVVLIPFID

EKRLLEAMET

CNHSLKKEER

KRNQHSECLM

CWYDRDTEFI

YPSPWPEKFP

AIERCCTRYK

IISLDAWRVD

INKNKITRID

QKALYFCGFP

TLKHIRHKFF

LKKSGVQVFQ

QSSRGENMML

EILVDAESDE

LTVENVASSV

LGKSVFVNWP

HLEEARVVAV

SDGETKFYLE

EPPGTQKLYS

GRTAPPSKVV

HLGDKEQSNW

AKEVQGISEH

YLRRKGIIIN

ETSAVVYAQL

LTGRKYQINQ

NGEVRLEKQW

SKQVVPFVYQ

TIVKDIRAFD

SRFSNIKTLD

DLFPLRSMVF

MLGTPYYGCT

GEVQDSGDVI

TEGRIRVIFS

IPCEPNLDAL

IQNQHKYSIK

YNPGYVLASR

LGVSGYLVSR

FTGSIFIGRG

SRRNPHGDHK

ANVGLNLKFN

KKNEEVPGYT

KKVGSEWMYS

SAAEQLLAEY

LERAPELFSY

IAKNSQEDVF

YEDDIWPGEN

ENGAEKVQEI

ITWLKGHPVS

TLSRSSCDLQ

ILDAAIVEKI

EEEVEKCKQR

KNNKKVRVTV

KPHLLYRPLE

QQHGVIPDRD

AEFCLFDRVV

NVRENFSVPV

GLRGTIIGIK

GANREADVLF

EVLFDEEFPG

GLTIRCSPGR

GYRLPTSALV

NLSHGSRSET

GNQKLTAIVK

PQPAVHQHSS

SSSVSSGHLG

ALNHSPQSLF

VPTQVPTKDD

DEFCNIWQSL

QGSGKMQYFQ

PTIQEKGAVL

PQEISQVNQH

HKSGFNDNSV

KYQQRKHDPH

RKFKEECKSP

KAECWSQKMS

NKQPNSGIEN

FLASLNISKE

NEVQSSHHGE

PPSEEHLSPQ

SFAMGTRMLK

EILKIDGSNT

VDHKNEIKQI

ANEIPVSSNR

RDEYGLPSQP

KQNKKLASYM

NKPHSANEYH

NVQSMDNMCW

PAPSQIPPVS

TPVTELSRIC

SLVGMPQPDF

SFLRMPQTMT

VCQVKLSNGL

LVHGPQCHSE

NEAKEKAALF

ALQQLGSLGM

NFPLPSQVFA

NYPSAVPPGT

IPPAFPPPTG

WDHYGSNYAL

GAANIMPSSS

HLFGSMPWGP

SVPVPGKPFH

HTLYSGTMPM

AGGIPGGVHN

QFIPLQVTKK

RVANKKNFEN

KEAQSSQATP

VQTSQPDSSN

IVKVSPRESS

SASLKSSPIA

QPASSFQVET

ASQGHSISHH

KSTPISSSRR

KSRKLAVNFG

VSKPSE


Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК.
Локалізований у цитоплазмі.



Література |


.mw-parser-output .refbeginfont-size:90%;margin-bottom:0.5em.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ullist-style-type:none;margin-left:0.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>ddmargin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none.mw-parser-output .refbegin-100font-size:100%


  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504


  • Lejeune F., Li X., Maquat L.E. (2003). Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities.. Mol. Cell 12: 675 — 687.  PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(03)00349-6


  • Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1.. Genes Dev. 19: 351 — 361.  PubMed DOI:10.1101/gad.1282305


  • Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'.. Genes Dev. 22: 50 — 65.  PubMed DOI:10.1101/gad.1622708


  • Ingelfinger D., Arndt-Jovin D.J., Luehrmann R., Achsel T. (2002). The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci.. RNA 8: 1489 — 1501.  PubMed



Примітки |




  1. ↑ Human PubMed Reference:. 


  2. ↑ Mouse PubMed Reference:. 


  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30654 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017. 


  4. ↑ UniProt, Q8IZH2 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017. 



Див. також |


  • Хромосома 3



Молекула міоглобіну
Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.


Wiki letter w.svg

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка, скористайтеся підказкою та розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.


-

Popular posts from this blog

Can not update quote_id field of “quote_item” table magento 2Magento 2.1 - We can't remove the item. (Shopping Cart doesnt allow us to remove items before becomes empty)Add value for custom quote item attribute using REST apiREST API endpoint v1/carts/cartId/items always returns error messageCorrect way to save entries to databaseHow to remove all associated quote objects of a customer completelyMagento 2 - Save value from custom input field to quote_itemGet quote_item data using quote id and product id filter in Magento 2How to set additional data to quote_item table from controller in Magento 2?What is the purpose of additional_data column in quote_item table in magento2Set Custom Price to Quote item magento2 from controller

Image
iPad being using in wall mount battery swollen Should I cover my bicycle overnight while bikepacking? Do UK voters know if their MP will be the Speaker of the House? Why can't we play rap on piano? Plagiarism or not? Why didn't Miles's spider sense work before? How to tell a function to use the default argument values? Short story with a alien planet, government officials must wear exploding medallions If human space travel is limited by the G force vulnerability, is there a way to counter G forces? What about the virus in 12 Monkeys? Is it acceptable for a professor to tell male students to not think that they are smarter than female students? Avoiding the "not like other girls" trope? Apex Framework / library for consuming REST services Is there an expression that means doing something right before you will need it rather than doing it in case you might need it? Method Does Not Exist error message How to show a landlord what we have...
Read more

How to solve knockout JS error in Magento 2 Planned maintenance scheduled April 23, 2019 at 23:30 UTC (7:30pm US/Eastern) Announcing the arrival of Valued Associate #679: Cesar Manara Unicorn Meta Zoo #1: Why another podcast?(Magento2) knockout.js:3012 Uncaught ReferenceError: Unable to process bindingUnable to process binding Knockout.js magento 2Cannot read property `scopeLabel` of undefined on Product Detail PageCan't get Customer Data on frontend in Magento 2Magento2 Order Summary - unable to process bindingKO templates are not loading in Magento 2.1 applicationgetting knockout js error magento 2Product grid not load -— Unable to process binding Knockout.js magento 2Product form not loaded in magento2Uncaught ReferenceError: Unable to process binding “if: function()return (isShowLegend()) ” magento 2

Image
Does the Pact of the Blade warlock feature allow me to customize the properties of the pact weapon I create? Why isn't everyone flabbergasted about Bran's "gift"? Paektu / Changbai border dispute — why does the BBC shade a large area around the mountain? Is it OK if I do not take the receipt in Germany? How to ask rejected full-time candidates to apply to teach individual courses? /bin/ls sorts differently than just ls What *exactly* is electrical current, voltage, and resistance? Coin Game with infinite paradox Diffie-Hellman with non-prime modulus Example of a central simple algebra Etymology of 見舞い Lights are flickering on and off after accidentally bumping into light switch A journey... into the MIND How to calculate density of unknown planet? How to produce a PS1 prompt in bash or ksh93 similar to tcsh What's the connection between Mr. Nancy and fried chicken? How can I delete rows in the text? How is it possible to imple...
Read more

Nissan Patrol Зміст Перше покоління — 4W60 (1951-1960) | Друге покоління — 60 series (1960-1980) | Третє покоління (1980–2002) | Четверте покоління — Y60 (1987–1998) | П'яте покоління — Y61 (1997–2013) | Шосте покоління — Y62 (2010- ) | Посилання | Зноски | Навігаційне менюОфіційний український сайтТест-драйв Nissan Patrol 2010 7-го поколінняNissan PatrolКак мы тестировали Nissan Patrol 2016рвиправивши або дописавши її

Image
Автомобілі:ПозашляховикиАвтомобілі Nissan укр.автомобільNissanпозашляховиків195119601988двигун1951повнопривідникомамериканськийWillysарміїкузовомпікапиPerkins1987ЯпоніїІспанії2000дизельним ...
Read more