XRN1 Література | Примітки | Див. також | Навігаційне менюXRN18919645894XRN1DNA bindingprotein bindingnucleic acid bindingnuclease activityexonuclease activityhydrolase activityRNA bindingG-quadruplex RNA bindingG-quadruplex DNA binding5'-3' exoribonuclease activitytelomerase RNA binding5'-3' exonuclease activityмембранаЦитоплазматична мембранаклітинне ядроЦитоплазмаГіалоплазмаДендрит (нейробіологія)neuronal cell bodyСинапсP-bodyregulation of mRNA stabilityrRNA catabolic processnuclear mRNA surveillancehistone mRNA catabolic processnegative regulation of translationresponse to testosteronecellular response to cycloheximideRNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolyticcellular response to puromycinnegative regulation of telomere maintenance via telomerasenuclear-transcribed mRNA catabolic processAmigoQuickGO5446424127ENSG00000114127ENSMUSG00000032410Q8IZH2P97789NM_001042604NM_001282857NM_001282859NM_019001NM_011916NM_001311130NP_001269786NP_001269788NP_061874Хр. 3: 142.31 – 142.45 MbХр. 9: 95.95 – 96.06 MbPubMed10.1101/gr.2596504PubMed10.1016/S1097-2765(03)00349-6PubMed10.1101/gad.1282305PubMed10.1101/gad.1622708PubMedHuman PubMed Reference:Mouse PubMed Reference:HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30654UniProt, Q8IZH2виправивши або дописавши їїпідказкою

Multi tool use
Multi tool use

Гени на хромосомі 3Некатегоризовані білки


англ.амінокислотмолекулярна масагідролазекзонуклеазнуклеазфосфопротеїнівальтернативний сплайсингДНКРНКцитоплазмі


































XRN1
Ідентифікатори

Символи

XRN1, SEP1, 5'-3' exoribonuclease 1
Зовнішні ІД
MGI: 891964 HomoloGene: 5894 GeneCards: XRN1








Ортологи
ВидиЛюдинаМиша
Entrez
Ensembl

UniProt

RefSeq (мРНК)

NM_001042604
NM_001282857
NM_001282859
NM_019001



NM_011916
NM_001311130

RefSeq (білок)

NP_001269786
NP_001269788
NP_061874


н/д
Локус (UCSC)
Хр. 3: 142.31 – 142.45 Mb

Хр. 9: 95.95 – 96.06 Mb

PubMed search

[1]
[2]
Вікідані


Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

XRN1 (англ. 5'-3' exoribonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-ї хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 706 амінокислот, а молекулярна маса — 194 107[4].



Послідовність амінокислот





























































































































































































































































































































1020304050

MGVPKFYRWI

SERYPCLSEV

VKEHQIPEFD

NLYLDMNGII

HQCSHPNDDD

VHFRISDDKI

FTDIFHYLEV

LFRIIKPRKV

FFMAVDGVAP

RAKMNQQRGR

RFRSAKEAED

KIKKAIEKGE

TLPTEARFDS

NCITPGTEFM

ARLHEHLKYF

VNMKISTDKS

WQGVTIYFSG

HETPGEGEHK

IMEFIRSEKA

KPDHDPNTRH

CLYGLDADLI

MLGLTSHEAH

FSLLREEVRF

GGKKTQRVCA

PEETTFHLLH

LSLMREYIDY

EFSVLKEKIT

FKYDIERIID

DWILMGFLVG

NDFIPHLPHL

HINHDALPLL

YGTYVTILPE

LGGYINESGH

LNLPRFEKYL

VKLSDFDREH

FSEVFVDLKW

FESKVGNKYL

NEAAGVAAEE

ARNYKEKKKL

KGQENSLCWT

ALDKNEGEMI

TSKDNLEDET

EDDDLFETEF

RQYKRTYYMT

KMGVDVVSDD

FLADQAACYV

QAIQWILHYY

YHGVQSWSWY

YPYHYAPFLS

DIHNISTLKI

HFELGKPFKP

FEQLLAVLPA

ASKNLLPACY

QHLMTNEDSP

IIEYYPPDFK

TDLNGKQQEW

EAVVLIPFID

EKRLLEAMET

CNHSLKKEER

KRNQHSECLM

CWYDRDTEFI

YPSPWPEKFP

AIERCCTRYK

IISLDAWRVD

INKNKITRID

QKALYFCGFP

TLKHIRHKFF

LKKSGVQVFQ

QSSRGENMML

EILVDAESDE

LTVENVASSV

LGKSVFVNWP

HLEEARVVAV

SDGETKFYLE

EPPGTQKLYS

GRTAPPSKVV

HLGDKEQSNW

AKEVQGISEH

YLRRKGIIIN

ETSAVVYAQL

LTGRKYQINQ

NGEVRLEKQW

SKQVVPFVYQ

TIVKDIRAFD

SRFSNIKTLD

DLFPLRSMVF

MLGTPYYGCT

GEVQDSGDVI

TEGRIRVIFS

IPCEPNLDAL

IQNQHKYSIK

YNPGYVLASR

LGVSGYLVSR

FTGSIFIGRG

SRRNPHGDHK

ANVGLNLKFN

KKNEEVPGYT

KKVGSEWMYS

SAAEQLLAEY

LERAPELFSY

IAKNSQEDVF

YEDDIWPGEN

ENGAEKVQEI

ITWLKGHPVS

TLSRSSCDLQ

ILDAAIVEKI

EEEVEKCKQR

KNNKKVRVTV

KPHLLYRPLE

QQHGVIPDRD

AEFCLFDRVV

NVRENFSVPV

GLRGTIIGIK

GANREADVLF

EVLFDEEFPG

GLTIRCSPGR

GYRLPTSALV

NLSHGSRSET

GNQKLTAIVK

PQPAVHQHSS

SSSVSSGHLG

ALNHSPQSLF

VPTQVPTKDD

DEFCNIWQSL

QGSGKMQYFQ

PTIQEKGAVL

PQEISQVNQH

HKSGFNDNSV

KYQQRKHDPH

RKFKEECKSP

KAECWSQKMS

NKQPNSGIEN

FLASLNISKE

NEVQSSHHGE

PPSEEHLSPQ

SFAMGTRMLK

EILKIDGSNT

VDHKNEIKQI

ANEIPVSSNR

RDEYGLPSQP

KQNKKLASYM

NKPHSANEYH

NVQSMDNMCW

PAPSQIPPVS

TPVTELSRIC

SLVGMPQPDF

SFLRMPQTMT

VCQVKLSNGL

LVHGPQCHSE

NEAKEKAALF

ALQQLGSLGM

NFPLPSQVFA

NYPSAVPPGT

IPPAFPPPTG

WDHYGSNYAL

GAANIMPSSS

HLFGSMPWGP

SVPVPGKPFH

HTLYSGTMPM

AGGIPGGVHN

QFIPLQVTKK

RVANKKNFEN

KEAQSSQATP

VQTSQPDSSN

IVKVSPRESS

SASLKSSPIA

QPASSFQVET

ASQGHSISHH

KSTPISSSRR

KSRKLAVNFG

VSKPSE


Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК.
Локалізований у цитоплазмі.



Література |


.mw-parser-output .refbeginfont-size:90%;margin-bottom:0.5em.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ullist-style-type:none;margin-left:0.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>ddmargin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none.mw-parser-output .refbegin-100font-size:100%


  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504


  • Lejeune F., Li X., Maquat L.E. (2003). Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities.. Mol. Cell 12: 675 — 687.  PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(03)00349-6


  • Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1.. Genes Dev. 19: 351 — 361.  PubMed DOI:10.1101/gad.1282305


  • Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'.. Genes Dev. 22: 50 — 65.  PubMed DOI:10.1101/gad.1622708


  • Ingelfinger D., Arndt-Jovin D.J., Luehrmann R., Achsel T. (2002). The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci.. RNA 8: 1489 — 1501.  PubMed



Примітки |




  1. Human PubMed Reference:. 


  2. Mouse PubMed Reference:. 


  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30654 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017. 


  4. UniProt, Q8IZH2 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017. 



Див. також |


  • Хромосома 3





HMT1J0XR 2eYRi2wMLYedJ vfCTl5DPZY,jns88UaEbaYXgEK xvLsvC DkujIrFxVntudr0ky,fJavqA3P
ezrm c6F0Pr I99ZX1WShM9Kxh1vrdd89HNHKGT

Popular posts from this blog

Nissan Patrol Зміст Перше покоління — 4W60 (1951-1960) | Друге покоління — 60 series (1960-1980) | Третє покоління (1980–2002) | Четверте покоління — Y60 (1987–1998) | П'яте покоління — Y61 (1997–2013) | Шосте покоління — Y62 (2010- ) | Посилання | Зноски | Навігаційне менюОфіційний український сайтТест-драйв Nissan Patrol 2010 7-го поколінняNissan PatrolКак мы тестировали Nissan Patrol 2016рвиправивши або дописавши її

No such entity with customerId The Next CEO of Stack OverflowTruncate table using resource model in Magento 2Custom Customer Attribute (string) get function not workingGetting current customer in custom REST API moduleSubstitute existing Customer EAV AttributesMagento 2 - Best practice for extending customer entityFatal error: Call to a member function create() on nullProduct custom attribute import with CSV Magento 2.2What is the distinction between defining a customer attribute as “system” versus not “user defined”?Custom EAV Entity Type Missing “default_attribute_set_id” In ModelMagento 2.2: Add Customer Attribute to Custom Tab in AdminHow to mass update custom dropdown customer attribute to all customers? PHP or SQL

Буцька Катерина Петрівна Зміст Біографія | Фільмографія | Дублювання та озвучення українською | Дублювання та озвучення російською | Озвучення реклами | Навігаційне менюперевірена109 змінвиправивши або дописавши її