Mryntu

DDX23 Література | Примітки | Див. також | Навігаційне менюPDBeRCSB4NHO3JCRDDX2319216013542DDX23nucleotide bindingATP-dependent RNA helicase activityhelicase activityATP-dependent helicase activityprotein bindingnucleic acid bindinghydrolase activityATP bindingRNA bindingcatalytic step 2 spliceosomeU5 snRNPnucleoplasmspliceosomal complexextracellular exosomeклітинне ядроЯдерцеЦитоплазмаmRNA splicing, via spliceosomeRNA splicing, via transesterification reactionsmRNA processingRNA secondary structure unwindingСплайсингcis assembly of pre-catalytic spliceosomeAmigoQuickGOБільше даних941674351ENSG00000174243ENSMUSG00000003360Q9BUQ8NM_004818NM_001080981NP_004809Хр. 12: 48.83 – 48.85 MbХр. 15: 98.65 – 98.66 MbPubMed10.1101/gr.2596504PubMed10.1017/S1355838202021088PubMed10.1261/rna.55406PubMed10.1158/1541-7786.MCR-10-0042PubMedHuman PubMed Reference:Mouse PubMed Reference:HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17347UniProt, Q9BUQ8виправивши або дописавши їїпідказкою

Гени на хромосомі 12Некатегоризовані білки

англ.амінокислотмолекулярна масагідролазгеліказфосфопротеїнівпроцесинг мРНКсплайсингальтернативний сплайсингАТФнуклеотидамиядрі

DDX23
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NHO, 3JCR
Ідентифікатори
Символи	DDX23, PRPF28, SNRNP100, U5-100K, U5-100KD, prp28, DEAD-box helicase 23
Зовнішні ІД	MGI: 1921601 HomoloGene: 3542 GeneCards: DDX23
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATP-dependent RNA helicase activity • helicase activity • ATP-dependent helicase activity • protein binding • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • U5 snRNP • nucleoplasm • spliceosomal complex • extracellular exosome • клітинне ядро • Ядерце • Цитоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA processing • RNA secondary structure unwinding • Сплайсинг • cis assembly of pre-catalytic spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9416	74351
Ensembl	ENSG00000174243	ENSMUSG00000003360
UniProt	Q9BUQ8	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_004818	NM_001080981
RefSeq (білок)	NP_004809	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 48.83 – 48.85 Mb	Хр. 15: 98.65 – 98.66 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX23 (англ. DEAD-box helicase 23) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 820 амінокислот, а молекулярна маса — 95 583^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGELADKKD		RDASPSKEER		KRSRTPDRER		DRDRDRKSSP		SKDRKRHRSR
DRRRGGSRSR		SRSRSKSAER		ERRHKERERD		KERDRNKKDR		DRDKDGHRRD
KDRKRSSLSP		GRGKDFKSRK		DRDSKKDEED		EHGDKKPKAQ		PLSLEELLAK
KKAEEEAEAK		PKFLSKAERE		AEALKRRQQE		VEERQRMLEE		ERKKRKQFQD
LGRKMLEDPQ		ERERRERRER		MERETNGNED		EEGRQKIREE		KDKSKELHAI
KERYLGGIKK		RRRTRHLNDR		KFVFEWDASE		DTSIDYNPLY		KERHQVQLLG
RGFIAGIDLK		QQKREQSRFY		GDLMEKRRTL		EEKEQEEARL		RKLRKKEAKQ
RWDDRHWSQK		KLDEMTDRDW		RIFREDYSIT		TKGGKIPNPI		RSWKDSSLPP
HILEVIDKCG		YKEPTPIQRQ		AIPIGLQNRD		IIGVAETGSG		KTAAFLIPLL
VWITTLPKID		RIEESDQGPY		AIILAPTREL		AQQIEEETIK		FGKPLGIRTV
AVIGGISRED		QGFRLRMGCE		IVIATPGRLI		DVLENRYLVL		SRCTYVVLDE
ADRMIDMGFE		PDVQKILEHM		PVSNQKPDTD		EAEDPEKMLA		NFESGKHKYR
QTVMFTATMP		PAVERLARSY		LRRPAVVYIG		SAGKPHERVE		QKVFLMSESE
KRKKLLAILE		QGFDPPIIIF		VNQKKGCDVL		AKSLEKMGYN		ACTLHGGKGQ
EQREFALSNL		KAGAKDILVA		TDVAGRGIDI		QDVSMVVNYD		MAKNIEDYIH
RIGRTGRAGK		SGVAITFLTK		EDSAVFYELK		QAILESPVSS		CPPELANHPD
AQHKPGTILT		KKRREETIFA

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.
Локалізований у ядрі.

Література |

.mw-parser-output .refbeginfont-size:90%;margin-bottom:0.5em.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ullist-style-type:none;margin-left:0.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>ddmargin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none.mw-parser-output .refbegin-100font-size:100%

• 
  The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  


• 
  Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis.. RNA 8: 426 — 439.  PubMed DOI:10.1017/S1355838202021088
  


• 
  Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP.. RNA 12: 1418 — 1430.  PubMed DOI:10.1261/rna.55406
  


• 
  Gilmore-Hebert M., Ramabhadran R., Stern D.F. (2010). Interactions of ErbB4 and Kap1 connect the growth factor and DNA damage response pathways.. Mol. Cancer Res. 8: 1388 — 1398.  PubMed DOI:10.1158/1541-7786.MCR-10-0042
  


• 
  Teigelkamp S., Mundt C., Achsel T., Will C.L., Luehrmann R. (1997). The human U5 snRNP-specific 100-kD protein is an RS domain-containing, putative RNA helicase with significant homology to the yeast splicing factor Prp28p.. RNA 3: 1313 — 1326.  PubMed
  

Примітки |

1. 
   ↑ Human PubMed Reference:. 
   


2. 
   ↑ Mouse PubMed Reference:. 
   


3. 
   ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17347 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017. 
   


4. 
   ↑ UniProt, Q9BUQ8 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017. 
   

Див. також |

• Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка, скористайтеся підказкою та розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.

This page is only for reference, If you need detailed information, please check here