Mryntu

ALYREF;
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB ;
Список кодів PDB
	; 3ULH; ;
Ідентифікатори;
; Символи;	; ALYREF, ALY, ALY/REF, BEF, REF, THOC4, Aly/REF export factor
Зовнішні ІД	; HomoloGene: 134554 GeneCards: ALYREF ;
Онтологія гена
Молекулярна функція	; • protein binding; • nucleic acid binding; • RNA binding; ; ;
Клітинна компонента	; • Цитоплазма; • Гіалоплазма; • nuclear speck; • catalytic step 2 spliceosome; • мембрана; • transcription export complex; • exon-exon junction complex; • spliceosomal complex; • extracellular exosome; • nuclear chromosome, telomeric region; • клітинне ядро; • nucleoplasm; ; ;
Біологічний процес	; • regulation of DNA recombination; • mRNA splicing, via spliceosome; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA transport; • mRNA processing; • viral mRNA export from host cell nucleus; • mRNA export from nucleus; • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; • osteoblast differentiation; • replication fork processing; • viral process; • mRNA 3'-end processing; • Сплайсинг; • RNA export from nucleus; • транспорт; ; ;
	Джерела:Amigo / QuickGO;
Ортологи
	; 10189;
	; 690585;
	; ENSG00000183684;
	; ENSRNOG00000036687;
	; Q86V81;
	; D3ZXH7;
	; NM_005782;
	; NM_001109602;
	; NP_005773;
	; NP_001103072;
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ALYREF (англ. Aly/REF export factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 257 амінокислот, а молекулярна маса — 26 888^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADKMDMSLD	DIIKLNRSQR	GGRGGGRGRG	RAGSQGGRGG	GAQAAARVNR
GGGPIRNRPA	IARGAAGGGG	RNRPAPYSRP	KQLPDKWQHD	LFDSGFGGGA
GVETGGKLLV	SNLDFGVSDA	DIQELFAEFG	TLKKAAVHYD	RSGRSLGTAD
VHFERKADAL	KAMKQYNGVP	LDGRPMNIQL	VTSQIDAQRR	PAQSVNRGGM
TRNRGAGGFG	GGGGTRRGTR	GGARGRGRGA	GRNSKQQLSA	EELDAQLDAY
NARMDTS

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів.
Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК.
Білок має сайт для зв'язування з РНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література |

.mw-parser-output .refbeginfont-size:90%;margin-bottom:0.5em.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ullist-style-type:none;margin-left:0.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>ddmargin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none.mw-parser-output .refbegin-100font-size:100%

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Wichmann I., Garcia-Lozano J.R., Respaldiza N., Gonzalez-Escribano M.F., Nunez-Roldan A. (1999). Autoantibodies to transcriptional regulation proteins DEK and ALY in a patient with systemic lupus erythematosus.. Hum. Immunol. 60: 57 — 62. PubMed DOI:10.1016/S0198-8859(98)00085-8

Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome.. Genome Res. 12: 1231 — 1245. PubMed DOI:10.1101/gr.473902

Virbasius C.-M., Wagner S., Green M.R. (1999). A human nuclear-localized chaperone that regulates dimerization, DNA binding, and transcriptional activity of bZIP proteins.. Mol. Cell 4: 219 — 228. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(00)80369-X

Le Hir H., Izaurralde E., Maquat L.E., Moore M.J. (2000). The spliceosome deposits multiple proteins 20-24 nucleotides upstream of mRNA exon-exon junctions.. EMBO J. 19: 6860 — 6869. PubMed DOI:10.1093/emboj/19.24.6860

Kataoka N., Diem M.D., Kim V.N., Yong J., Dreyfuss G. (2001). Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex.. EMBO J. 20: 6424 — 6433. PubMed DOI:10.1093/emboj/20.22.6424

Примітки |

↑ Human PubMed Reference:.

↑ Mouse PubMed Reference:.

↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19071 (англ.). Процитовано 27 лютого 2017.

↑ UniProt, Q86V81 (англ.). Процитовано 27 лютого 2017.

Див. також |

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19071 (англ.). Процитовано 27 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q86V81 (англ.). Процитовано 27 лютого 2017.

搜尋此網誌

Mryntu

Література |

Примітки |

Див. також |

Popular posts from this blog